Духовное управление координирует деятельность мечетей на территории Омска и области, поддерживает религиозное образование, ведёт работу по сохранению духовно-нравственных ценностей, межконфессиональному и межнациональному согласию.

Главная задача управления — служение мусульманской умме региона: богослужения, религиозные обряды, помощь в вопросах веры и поддержание духовной жизни общины. Резиденция муфтия — мечеть «Хаир-Ихсан» в Омске.